慕谷慕魚因受到麥德姆颱風風災影響及銅門部落族人抗議，於2014年起進行將近一年的封山整建，於2015年6月6日再度開放，讓遊客以登山健行事由申請通行入山，雖然才開放近兩個月的時間，但因逢暑假旅遊旺季，加上沒有限制申請入山人數，開放至今已經有近2萬名遊客申請入山。
 
另外，由於慕谷慕魚重新於六月開放民眾步行入山，禁止車輛進入，不少民眾為了減少走路距離，將車輛塞滿管制站前，也造成了部落生活受到嚴重打擾。因此秀林鄉公所決議，自8月1日起實施新制，恢復每日入山上限600名，且遊客車輛僅能停放於慕谷慕魚遊客中心、銅門河腹地、榕樹防汛道路旁，機車可停放於台電舊宿舍等處。至於垃圾問題，鄉公所除編列經費雇用當地族人擔任清潔工，也與縣環保局協議，將成立「聯合稽查隊」，取締亂丟垃圾的遊客。

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